1) Заявление в отделение ФНС обязательно заверяется ЭП нотариуса в случае юр.лиц. ИП могут обойтись без нотариуса вообще. Остальные документы могут заверяться ЭП заявителя.
2) Для электронной регистрации необходим либо сертификат УЦ, являющегося доверенным УЦ ФНС РФ, либо все заверяется ЭП нотариуса.
3) При необходимости получения на руки бумажной копии учредительных документов заполняется специальный запрос (вложен в пакет электронных документов) и оплачивается пошлина.
4) Для упрощения работы пользователей ФНС РФ выложило в бесплатный доступ программу для подготовки заявлений (http://www.nalog.ru/el_usl/no_software/prog_ur/3776252/).
5) Отправить документы можно через нотариуса или самостоятельно (если есть ЭП), но только пользователям КриптоПро. Есть специальная программа для формирования пакета документов (http://www.nalog.ru/el_usl/no_software/3787498/)
6) Пока в проекте всего 5 нотариусов (http://www.nalog.ru/zero/3796290/).
Можно ли подать документы на гос регистрацию в электронном виде?